本书由上海交通大学邓子新院士牵头，国内9所高校从事微生物学教学、科研工作的老师共同编写而成，把握了微生物学近几十年来迅猛发展的脉络，从微生物的形态结构入手，再论及微生物分子生物学和基因重组技术，并对微生物生态学、宏基因组学与微生物演化进行了阐述，反映了现代微生物学和微生物生物技术发展的主流。全书共分15章，内容包括绪论、原核生物的结构与功能、真核微生物的结构与功能、病毒、微生物的营养、微生物的生长和控制、微生物代谢、微生物遗传与育种、微生物系统发育与分类、微生物生态与环境微生物、病原微生物、传染与免疫、微生物与食品、微生物与农业、工业微生物与发酵。

本书采用“纸质教材+数字课程”的出版形式，纸质教材内容精炼，各章均设置了知识导图、开放讨论题、推荐阅读等辅学内容；数字课程资源包括发现之路、知识拓展、科技视野、技术应用、视频、动画、教学课件、自测题、参考文献等内容，有助于学生自主学习，重构学习方式，更好地掌握知识点。

本书可作为高等院校生物技术、生物工程、生物科学、生物信息学等专业的教学用书，也可供从事相关研究和开发的人员参考。

前辅文
1 绪论
  1.1 微生物与微生物学
   1.1.1 什么是微生物与微生物学
   1.1.2 微生物的特点
   1.1.3 微生物对人类的影响
  1.2 微生物学的发展历程
   1.2.1 微生物的发现
   1.2.2 巴斯德与微生物学奠基
   1.2.3 科赫与微生物学奠基
   1.2.4 20 世纪微生物学的快速发展
  1.3 微生物学的未来
   1.3.1 微生物多样性与微生物组学研究
   1.3.2 基因工程菌的构建与大规模应用
   1.3.3 利用微生物治理环境污染
   1.3.4 新型传染病的防治
  1.4 如何学习微生物学
   1.4.1 微生物学的学习目标
   1.4.2 学习微生物学的方法与建议
2 原核生物的结构与功能
  2.1 原核生物的细胞结构概述
   2.1.1 原核生物的外部形态
   2.1.2 原核细胞的结构
  2.2 细胞膜
   2.2.1 细菌细胞膜的结构
   2.2.2 古菌细胞膜的结构
   2.2.3 细胞膜的功能
  2.3 细胞壁
   2.3.1 细菌的细胞壁
   2.3.2 缺壁细菌
   2.3.3 古菌的细胞壁
  2.4 拟核与质粒
   2.4.1 拟核
   2.4.2 质粒
  2.5 细胞表面结构与功能
   2.5.1 细菌鞭毛与菌体运动
   2.5.2 菌毛与性毛
   2.5.3 糖被结构
   2.5.4 菌鞘
   2.5.5 菌柄
  2.6 细胞质与内含物结构
   2.6.1 70S 核糖体
   2.6.2 内生芽胞
   2.6.3 颗粒状内含物
   2.6.4 气泡
3 真核微生物的结构与功能
  3.1 真核微生物细胞的结构与功能
   3.1.1 细胞壁
   3.1.2 细胞膜
   3.1.3 细胞核
   3.1.4 细胞质和细胞器
   3.1.5 细胞表面附属物
  3.2 真核微生物的分化
   3.2.1 真菌的营养体和繁殖体
   3.2.2 其他真核微生物的分化
  3.3 真核微生物的起源?分类和分子演化
   3.3.1 真核微生物的起源
   3.3.2 真核微生物的分类
   3.3.3 真核微生物的分子演化
4 病毒
  4.1 病毒的形态及分类
   4.1.1 病毒的形态与大小
   4.1.2 病毒的化学组成
   4.1.3 病毒的分类和命名
  4.2 病毒的增殖
   4.2.1 病毒增殖的一般特征
   4.2.2 病毒的吸附和侵入
   4.2.3 病毒核酸的复制和蛋白质的合成
   4.2.4 病毒的装配和释放
  4.3 病毒的培养与检测
   4.3.1 病毒的培养
   4.3.2 病毒的纯化
   4.3.3 病毒的检测
  4.4 病毒的主要类群
   4.4.1 噬菌体
   4.4.2 动物病毒
   4.4.3 植物病毒
   4.4.4 昆虫病毒
  4.5 亚病毒因子
   4.5.1 卫星病毒
   4.5.2 类病毒
   4.5.3 朊病毒
5 微生物的营养
  5.1 微生物的营养需求
   5.1.1 微生物的营养元素
   5.1.2 微生物的营养物质
   5.1.3 微生物的营养类型
  5.2 微生物的物质运输
   5.2.1 微生物对营养物质的吸收
   5.2.2 微生物的产物分泌
  5.3 培养基
   5.3.1 培养基的配制原则
   5.3.2 培养基的类型
6 微生物的生长和控制
  6.1 微生物的个体生长
   6.1.1 细菌细胞的生长与分裂
   6.1.2 同步生长与同步培养技术
   6.1.3 丝状真菌个体生长
  6.2 微生物的群体生长
   6.2.1 微生物生长曲线
   6.2.2 连续培养与连续发酵
  6.3 微生物生长的测定
   6.3.1 微生物计数
   6.3.2 微生物细胞质量测定
   6.3.3 微生物生理指标测定
  6.4 理化因素对微生物生长的影响
   6.4.1 温度
   6.4.2 pH
   6.4.3 氧气
  6.5 微生物的分离与培养
   6.5.1 无菌操作技术
   6.5.2 微生物分离纯化技术
   6.5.3 微生物的培养
  6.6 微生物生长的控制
   6.6.1 控制微生物生长的物理方法
   6.6.2 控制微生物生长的化学方法
7 微生物的代谢
  7.1 代谢的热力学
  7.2 微生物的能量代谢
   7.2.1 能量代谢概论
   7.2.2 化能异养微生物的生物氧化
   7.2.3 化能自养微生物的生物氧化
   7.2.4 光合微生物的能量产生
  7.3 微生物的物质代谢
   7.3.1 物质代谢概论
   7.3.2 合成代谢
   7.3.3 分解代谢
   7.3.4 初级代谢
   7.3.5 次级代谢
  7.4 微生物代谢的调控
   7.4.1 微生物调节代谢流的两种主要方式
   7.4.2 代谢调控原理在发酵工业的应用
8 微生物的遗传与育种
  8.1 遗传的物质基础
   8.1.1 DNA
   8.1.2 RNA
  8.2 微生物基因组
   8.2.1 大肠杆菌基因组
   8.2.2 酿酒酵母菌基因组
   8.2.3 链霉菌基因组
   8.2.4 丝状真菌基因组
   8.2.5 基因组测序
  8.3 质粒和转座因子
   8.3.1 质粒的结构
   8.3.2 质粒的主要类型
   8.3.3 质粒的特性
   8.3.4 转座因子的分子结构和类型
  8.4 微生物的突变
   8.4.1 突变与突变型
   8.4.2 突变的分子基础
   8.4.3 DNA 损伤的修复
  8.5 细菌的基因转移
   8.5.1 细菌的接合作用
   8.5.2 细菌的转化
   8.5.3 细菌的转导
  8.6 真菌的基因重组
   8.6.1 有性生殖
   8.6.2 准性生殖
  8.7 微生物的育种与保藏
   8.7.1 诱变育种
   8.7.2 基因重组育种
   8.7.3 代谢工程育种
   8.7.4 合成生物技术育种
   8.7.5 菌种的保藏
9 微生物的系统发育与分类
  9.1 微生物的系统发育学
   9.1.1 微生物与生命起源
   9.1.2 系统发育分析
   9.1.3 细胞生物的三域学说
  9.2 微生物分类特征和分类方法
   9.2.1 分类等级
   9.2.2 分类系统
   9.2.3 分类指标
  9.3 微生物分类鉴定
   9.3.1 微生物的命名法则
   9.3.2 微生物的系统发育鉴定方法
   9.3.3 微生物的自动鉴定系统
   9.3.4 微生物的多相分类学研究
  9.4 《伯杰氏系统细菌学手册》
   9.4.1 《伯杰氏系统细菌学手册》简介
   9.4.2 古菌系统发育概观
   9.4.3 细菌系统发育概观
10 微生物生态与环境微生物
  10.1 微生物生态学基础
   10.1.1 微生物生态系统
   10.1.2 微生物与微环境
   10.1.3 微生物聚集体
  10.2 环境中的微生物
   10.2.1 陆地环境中的微生物
   10.2.2 水环境中的微生物
   10.2.3 空气中的微生物
   10.2.4 极端环境中的微生物
   10.2.5 生物环境与微生物
  10.3 微生物与生物地球化学循环
   10.3.1 碳循环
   10.3.2 氮循环
   10.3.3 磷循环
   10.3.4 硫循环
   10.3.5 铁循环
  10.4 环境污染物的生物降解与生物修复
   10.4.1 难降解有机污染物的生物降解
   10.4.2 污水生物处理技术
   10.4.3 污染环境的生物修复
11 病原微生物
  11.1 人体正常微生物群落与病原微生物
   11.1.1 皮肤微生物群落
   11.1.2 口腔微生物群落
   11.1.3 胃肠道微生物群落
   11.1.4 人体其他部位的微生物群落
   11.1.5 食源性病毒
  11.2 植物病害
   11.2.1 真菌性植物病害
   11.2.2 细菌性植物病害
   11.2.3 病毒性植物病害
  11.3 病原微生物的毒力和致病性
   11.3.1 毒力测定
   11.3.2 致病菌入侵方式——黏附
   11.3.3 定植和感染
   11.3.4 侵染
   11.3.5 外毒素
   11.3.6 内毒素
  11.4 感染中的宿主因素
   11.4.1 感染宿主的风险因素
   11.4.2 天生对抗感染的抵抗力
12 传染与免疫
  12.1 传染
   12.1.1 传染与传染病
   12.1.2 决定传染结局的因素
   12.1.3 传染的结局
  12.2 免疫系统
   12.2.1 免疫器官
   12.2.2 免疫细胞
   12.2.3 免疫分子
  12.3 非特异性免疫
   12.3.1 屏障结构及其作用
   12.3.2 正常体液和组织中的抗菌物质
   12.3.3 吞噬细胞及其吞噬作用
   12.3.4 炎症反应
  12.4 特异性免疫
   12.4.1 抗原和抗体
   12.4.2 体液免疫
   12.4.3 细胞免疫
  12.5 免疫学技术及应用
   12.5.1 抗原- 抗体反应的一般规律
   12.5.2 传统的免疫学技术
   12.5.3 现代免疫学技术
   12.5.4 生物制品及其应用
13 微生物与食品
  13.1 微生物生长与食品腐败
   13.1.1 食品微生物的分类和作用
   13.1.2 各类食品中的腐败菌
   13.1.3 细菌性食物中毒
   13.1.4 真菌毒素中毒
   13.1.5 病毒性食物中毒
  13.2 食品腐败控制与保存
   13.2.1 影响微生物生长的食品内外因素
   13.2.2 化学和生物控制法保存食品
   13.2.3 物理方法保存食品
   13.2.4 栅栏理论在食品防腐保鲜上的应用
  13.3 食源性致病微生物的检测
   13.3.1 常规检验
   13.3.2 食源性致病微生物的检测方法
   13.3.3 预测食品微生物学
  13.4 微生物与食品工业
   13.4.1 发酵食品及生产工艺
   13.4.2 食用菌的分类与生产
   13.4.3 食品质量与安全的指示菌
14 微生物与农业
  14.1 微生物肥料
   14.1.1 植物根际促生细菌
   14.1.2 根瘤菌肥料
   14.1.3 固氮菌肥料
   14.1.4 解磷细菌肥料
   14.1.5 菌根菌肥料
  14.2 微生物农药
   14.2.1 微生物杀虫剂
   14.2.2 微生物杀菌剂
   14.2.3 微生物除草剂
  14.3 微生物饲料
   14.3.1 单细胞蛋白饲料
   14.3.2 青贮饲料
   14.3.3 发酵饲料
15 工业微生物与发酵
  15.1 微生物发酵生产概况及特点
   15.1.1 微生物发酵生产的历史
   15.1.2 微生物发酵生产的概况
   15.1.3 微生物发酵生产的特点
  15.2 微生物发酵
   15.2.1 微生物发酵形式和反应器类型
   15.2.2 微生物发酵的放大过程
   15.2.3 培养基的设计和优化
   15.2.4 发酵工艺和控制
  15.3 工业微生物的主要应用
   15.3.1 微生物发酵生产氨基酸
   15.3.2 微生物发酵生产酶制剂
   15.3.3 微生物发酵生产抗生素
   15.3.4 微生物能量代谢产物
   15.3.5 微生物与生物炼制
   15.3.6 微生物与生物能源
附录Ⅰ 名词索引
附录Ⅱ 微生物学名索引
附录Ⅱ 微生物中文名索引